实验准备:wako质谱级赖氨酰肽链内切酶125-05061
单位定义
俄罗斯专享会284中使用的酰胺酶单位被定义为在30℃、pH 9.5条件下,每分钟生成1μmol对硝基苯胺所需的酶量。单位计算公式为:AU/vial = [(a-b)/25] × (1/962) × (40/01)
其中,a为样品吸光度,b为空白对照吸光度。
实验操作流程
在实验中,应使用聚硅酮处理的微量离心管和吸管,以避免与蛋白质的接触。建议使用专为质谱分析设计的凝胶染色试剂盒,例如银染剂MS试剂盒(产品编号:299-58901)和负凝胶染色MS试剂盒(产品编号:293-57701)。以下是详细步骤:- 对蛋白质样品进行电泳分离。
- 切割电泳后的蛋白质片段并放入微量离心管。
- 使用凝胶脱色液进行脱色处理。
- 向试管中添加300μL乙醇,搅拌并振荡30分钟。
- 去除乙醇并用Parafilm膜覆盖微量离心管。
- 在Parafilm膜上打孔并进行真空干燥15分钟。
- 将100μL 10mmol/L DTT溶解于100mmol/L碳酸氢铵中,56℃恒温1小时。
- 室温冷却后,加入等量的50mM碘乙酰胺于100mmol/L碳酸氢铵中,避光恒温45分钟并涡旋。
- 用100μL 100mmol/L碳酸氢铵洗涤凝胶片段10分钟。
- 用300μL乙醇干燥凝胶片段15分钟。
- 用100μL 100mmol/L碳酸氢铵使凝胶片段膨胀15分钟。
- 再次用300μL乙醇干燥凝胶片段15分钟。
- 去除液相并进行真空干燥15分钟。
- 用100μL赖氨酸内切酶溶液在冰水浴中使凝胶片段膨胀45分钟。
- 去除100μL赖氨酸内切酶溶液,将凝胶片段在37℃、10μL 50mmol/L Tris-HCl (pH 8.5)中储存过夜。
- 加入50μL 20mmol/L碳酸氢铵,振荡凝胶片段3次以提取多肽,持续20分钟。
- 用5%甲酸/50%乙醇再次提取多肽,振荡3次,持续20分钟。
- 如有需要,可使用SpeedVac浓缩多肽。
- 使用ZipTip进行多肽的脱盐和纯化。
- 如有需要,使用低真空浓缩多肽至2μL。
- 最后加入基质以进行质谱分析。