中文

English

俄罗斯专享会284:无需培养的全亚型结核耐药基因靶向NGS方案

发布时间:2025-02-25   信息来源:王芝振

结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是一种重要的全球性致病菌,其引发的结核病是一种致死率极高的疾病。标准株H37Rv于1998年完成了基因组测序,基因组大小约44Mb,包含超过3900个蛋白编码基因。结核分枝杆菌可以分为7个主要谱系,已知的耐药基因有embB、rpoB、gyrA等[1]。

俄罗斯专享会284:无需培养的全亚型结核耐药基因靶向NGS方案

根据2023年10月17日世界卫生组织(WHO)官网发布的《应用新一代测序检测技术开展耐药结核病监测的实施性手册》,WHO认为新一代测序(NGS)技术能够提供全面的耐药谱系检测,从而减少对传统表型药敏检测的依赖,尤其对那些表型药敏检测结果不可靠的药物更为重要。NGS技术有望为结核病的治疗方案提供更全面的耐药谱检测,进而提高化疗方案的精准性。

由于结核杆菌的基因组较大,目前的靶向结核NGS方法(tNGS)往往无法覆盖所有亚型和耐药基因。尽管全基因组测序(WGS)能覆盖整个基因组,但通常需要培养物以保障检测的可靠性。为了应对这一挑战,QIAGEN推出了QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis Panel,这款试剂盒无需培养,即可直接实现结核全基因组靶向建库,并覆盖7种主要谱系亚型及所有已知的耐药基因。

QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis Panel基于杂交捕获技术,支持利用痰液、脑脊液、粪便等样本进行结核全基因组测序。它仅需10ng的起始DNA,无需提前培养。高特异性和灵敏度的捕获探针,即使面对低拷贝样本也能实现高覆盖率。对于难以覆盖的PE/PPE基因区域,也能实现均匀的高深度覆盖,从而有助于明确TB的类型。

在获得结核病(TB)的全基因组数据后,可以使用CLC Genomics Workbench的结核分枝杆菌分析工具和流程,实现质量控制、序列比对、谱系鉴定及耐药变异等一键式分析。此外,还可以进行变异注释与比较、变异对蛋白结构的影响评估、cgMLST分型、最小生成树和SNP tree构建等分析。

除了QIAseq xHYB Mycobacterium tuberculosis Panel外,QIAGEN还推出了QIAseq xHYB HepC Panel,用于丙肝病毒的全基因靶向测序,涵盖所有丙肝病毒亚型,并无缝对接CLC Genomics Workbench生物信息分析系统,以便用户一键获得分析结果。未来,QIAseq xHYB还将推出针对客户目标微生物的定制化靶向Panel,敬请期待!如需了解更多信息,请扫描下方二维码与我们联系。

俄罗斯专享会284为您提供更多前沿资讯与高端服务,敬请关注!